Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Grik4Q8BMF5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Grik4Q8BMF5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Grik4Q8BMF5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Grik4Q8BMF5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms