Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Nop53Q8BK35 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Nop53Q8BK35 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Nop53Q8BK35 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Nop53Q8BK35 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Nop53Q8BK35 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Nop53Q8BK35 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Nop53Q8BK35 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Nop53Q8BK35 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop53Q8BK35 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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