Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms