Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms