Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Best2Q8BGM5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Best2Q8BGM5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Best2Q8BGM5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Best2Q8BGM5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Best2Q8BGM5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Best2Q8BGM5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Best2Q8BGM5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Best2Q8BGM5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Best2Q8BGM5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Best2Q8BGM5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Best2Q8BGM5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Best2Q8BGM5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Best2Q8BGM5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Best2Q8BGM5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Best2Q8BGM5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Best2Q8BGM5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Best2Q8BGM5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Best2Q8BGM5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Best2Q8BGM5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Best2Q8BGM5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Best2Q8BGM5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Best2Q8BGM5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Best2Q8BGM5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Best2Q8BGM5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Best2Q8BGM5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Best2Q8BGM5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Best2Q8BGM5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Best2Q8BGM5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Best2Q8BGM5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Best2Q8BGM5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Best2Q8BGM5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Best2Q8BGM5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Best2Q8BGM5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Best2Q8BGM5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms