Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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