Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms