Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms