Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms