Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms