Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms