Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms