Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sestd1Q80UK0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms