Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll4Q80UG8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll4Q80UG8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms