Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms