Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ClmQ7TSN2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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