Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms