Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms