Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubfd1Q78JW9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubfd1Q78JW9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubfd1Q78JW9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubfd1Q78JW9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubfd1Q78JW9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubfd1Q78JW9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubfd1Q78JW9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubfd1Q78JW9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubfd1Q78JW9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubfd1Q78JW9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubfd1Q78JW9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubfd1Q78JW9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubfd1Q78JW9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubfd1Q78JW9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ubfd1Q78JW9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ubfd1Q78JW9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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