Protein–RNA interactions for Protein: Q78JE5

Fbxo22, F-box only protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo22Q78JE5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Fbxo22Q78JE5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo22Q78JE5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms