Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms