Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup188Q6ZQH8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms