Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms