Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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