Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms