Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb39Q6PDK0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms