Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms