Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gapvd1Q6PAR5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gapvd1Q6PAR5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms