Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5G6

Ubxn7, UBX domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn7Q6P5G6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn7Q6P5G6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn7Q6P5G6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn7Q6P5G6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn7Q6P5G6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn7Q6P5G6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn7Q6P5G6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn7Q6P5G6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn7Q6P5G6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn7Q6P5G6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn7Q6P5G6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn7Q6P5G6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms