Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms