Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms