Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms