Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms