Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gpbp1Q6NXH3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms