Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sp140Q6NSQ5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Sp140Q6NSQ5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Sp140Q6NSQ5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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