Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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