Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms