Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms