Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q66JV7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q66JV7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q66JV7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q66JV7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q66JV7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q66JV7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q66JV7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q66JV7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q66JV7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q66JV7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q66JV7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q66JV7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q66JV7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q66JV7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q66JV7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q66JV7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q66JV7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q66JV7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q66JV7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q66JV7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q66JV7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q66JV7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q66JV7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q66JV7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q66JV7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q66JV7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q66JV7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q66JV7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q66JV7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q66JV7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q66JV7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q66JV7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q66JV7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q66JV7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q66JV7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q66JV7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q66JV7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Q66JV7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q66JV7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Q66JV7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Q66JV7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q66JV7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q66JV7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q66JV7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q66JV7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q66JV7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q66JV7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q66JV7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Q66JV7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q66JV7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q66JV7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q66JV7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q66JV7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q66JV7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q66JV7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q66JV7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q66JV7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q66JV7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q66JV7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q66JV7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q66JV7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q66JV7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q66JV7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q66JV7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q66JV7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q66JV7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q66JV7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q66JV7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q66JV7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q66JV7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q66JV7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q66JV7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q66JV7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q66JV7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q66JV7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q66JV7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q66JV7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q66JV7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Q66JV7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q66JV7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q66JV7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q66JV7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q66JV7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q66JV7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q66JV7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q66JV7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q66JV7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q66JV7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q66JV7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q66JV7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q66JV7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q66JV7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q66JV7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q66JV7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q66JV7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q66JV7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q66JV7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Q66JV7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q66JV7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms