Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms