Protein–RNA interactions for Protein: Q64343

Abcg1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg1Q64343 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms