Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms