Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

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Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AtmQ62388 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AtmQ62388 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AtmQ62388 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtmQ62388 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtmQ62388 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtmQ62388 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtmQ62388 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtmQ62388 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtmQ62388 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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AtmQ62388 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
AtmQ62388 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AtmQ62388 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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AtmQ62388 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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AtmQ62388 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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AtmQ62388 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtmQ62388 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtmQ62388 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtmQ62388 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtmQ62388 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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