Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itm2aQ61500 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms