Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms