Protein–RNA interactions for Protein: Q61122

Nab1, NGFI-A-binding protein 1, mousemouse

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Length 486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nab1Q61122 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Nab1Q61122 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Nab1Q61122 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms