Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms