Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm1Q60636 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms