Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Tdrd5Q5VCS6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Tdrd5Q5VCS6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Tdrd5Q5VCS6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Tdrd5Q5VCS6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Tdrd5Q5VCS6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Tdrd5Q5VCS6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Tdrd5Q5VCS6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Tdrd5Q5VCS6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Tdrd5Q5VCS6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Tdrd5Q5VCS6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Tdrd5Q5VCS6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms