Protein–RNA interactions for Protein: Q5U406

Zfp78, Zinc finger protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp78Q5U406 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp78Q5U406 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp78Q5U406 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp78Q5U406 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp78Q5U406 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp78Q5U406 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Zfp78Q5U406 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Zfp78Q5U406 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Zfp78Q5U406 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Zfp78Q5U406 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Zfp78Q5U406 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp78Q5U406 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp78Q5U406 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp78Q5U406 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Zfp78Q5U406 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Zfp78Q5U406 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Zfp78Q5U406 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Zfp78Q5U406 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Zfp78Q5U406 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Zfp78Q5U406 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Zfp78Q5U406 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp78Q5U406 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp78Q5U406 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp78Q5U406 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp78Q5U406 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp78Q5U406 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp78Q5U406 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp78Q5U406 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp78Q5U406 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Zfp78Q5U406 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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